Kontrollen skjer mellom anna ved at Finanstilsynet vurderar dei styrings- og kontrollfunksjonane selskapa etablerer og går gjennom rekneskap og dokument. Når Finansdepartementet handsamar saker som gjeld finansmarknaden, er det vanleg å be om Finanstilsynet si vurdering før ei avgjersle vert teken.
Finanstilsynet skal kvart år gje Finansdepartementet ei melding om si verksemd. Denne legg Finansdepartementet fram for Stortinget i ei årleg kredittmelding. Etaten sine utgifter dekkes i heilskap av dei institusjonane som det førast tilsyn med. Finanstilsynet hadde ved utgongen av 2005 196 tilsette.