Forsvarsministeren er Forsvarsdepartementets sjef og politiske leder. Hun har en statssekretær og en politisk rådgiver.
Departementsråden er departementets høyeste faste embetsmann. Departementsråden skal avlaste og være rådgiver for statsråden i arbeidet med ledelse og samordning av departementets arbeid.
Departementsråden har i sin stab en assisterende departementsråd som fungerer i departementsrådens fravær, en internrevisjon, en kommunikasjonsenhet og et sekretariat.
Departementet er inndelt i fire fagavdelinger som ledes av hver sin ekspedisjonssjef:
Forsvarsdepartementet har disse underliggende etatene:
- Forsvaret
er Forsvarsdepartementets største underliggende etat med ansvar for styrkeproduksjon og de ulike våpengrener.
- Forsvarets forskningsinstitutt (FFI)
har til formål å drive forskning og utvikling for Forsvarets behov. FFI skal være Forsvarets politiske og militære ledelses rådgiver i faglige spørsmål innenfor instituttets arbeidsområde.
- Forsvarsbygg
har kontorer over hele landet og har ansvar for all bygningsmasse i Forsvaret.
-
Nasjonal sikkerhetsmyndighet (NSM)
er opprettet som direktorat med virkning fra 1.januar 2003. Direktoratet er administrativt underlagt Forsvarsdepartementet, og rapporterer med faglig ansvarslinje til Justisdepartementet for oppgave løsning i sivil sektor og til Forsvarsdepartementet for militær sektor.