Folkehelseavdelingens hovedoppgaver er knyttet til helsefremmende og forebyggende arbeid, helseovervåkning og helseregistre, ernæring og mattrygghet, legemiddelspørsmål og alkohol- og narkotikaspørsmål.
Videreutvikling av spesialisthelsetjenesten er hovedoppgaven for avdelingen, med særlig oppmerksomhet på kvalitet og tilgjengelighet, samt følgene av den demografiske og den medisinske utviklingen i samfunnet.
Helse- og omsorgsdepartementet forvalter eierskapet til de regionale helseforetakene og Norsk Helsenett SF, Eieravdelingens hovedoppgave er å ivareta eierstyringen.
Helserettsavdelingen har ansvaret for de fleste lovene og forskriftene som ligger under Helse- og omsorgsdepartementets område.
Avdelingen bidrar til å utvikle de kommunalpolitiske virkemidlene i forhold til blant annet kommunehelsetjenesten, omsorgstjenesten, sosialtjenesten og psykisk helsearbeid i kommunene.
Budsjett- og økonomiavdelingen samordner arbeid med statsbudsjettet i Helse- og omsorgsdepartementet, koordinerer saker til Riksrevisjonen og har et overordnet ansvar for økonomiforvaltningen i departementet.
Administrasjonsavdelingen har ansvar for fellesoppgaver i Helse- og omsorgsdepartementet og skal bidra til at departementet arbeider i tråd med sentrale mål og retningslinjer for statsforvaltningen.
Enheten har hovedansvar for kontakt med media, web-sider, brosjyrer og krisekommunikasjon.